Государственная Дума давно уже является неким симулякром, имитирующим народное представительство. Поэтому насколько она легитимна — непринципиально.
Однако, исходя из букв закона, выборы должны проходить честно и без незаконных манипуляций сторон в пользу своих кандидатов. Поэтому существуют 141 и 142 статьи Уголовного кодекса РФ, многочисленные регламентирующие документы. Для того, чтобы они действовали, достаточно обязать власти их применять на практике. Как говорил Путин, независимо от уровня персон, нарушающих закон о выборах.
Кроме того, перестать мудрить с лепестковыми нарезками округов, с согласованиями персон кандидатов в депутаты и недопущении к выборам неугодных власти персон; честно проводить праймериз. А также предоставлять равные права всем кандидатам на СМИ, наружную рекламу, встречи с избирателями. Не угрожать бюджетникам, заставляя их голосовать за нужные партии и кандидатов; не принуждать последних к обязательному посещению участков голосования с фотоотчетом за кого голосовал; не способствовать «каруселям» и манипуляциям с открепительными удостоверениями и досрочным голосованием. Не препятствовать работе и видеосъемке наблюдателей; не искажать данные подсчёта голосов; не подменять протоколы голосования на более удобные власти…
Выборы президента должны быть честными. Президент точно не симулякр и нуждается в легитимном избрании большинством избирателей.
И поэтому все перечисленные проблемы все равно придётся поправлять.